Der Masterstudiengang Musiktherapie ist in 15 Module gegliedert. Diese widmen sich den Themenfeldern „Musiktherapeutische Grundlagen“, „Musizierpraxis“, „Praxeologie“, „Selbstreflexion“, „Medizinische Grundlagen“ und „Psychotherapeutisches Fachwissen“.

Für Studierende, die ihr Studium ab dem Wintersemester 2020/21 aufgenommen haben, gilt die Studien- und Prüfungsordnung, welche am 18.03.2020 in Kraft getreten ist und im Udk Anzeiger 03/2020 nachzulesen ist.

Für Studierende, die ihr Studium vorher begonnen haben, gilt die Zulassungs-, Studien- und Prüfungsordnung, welche im Udk-Anzeiger 11/2015  am 30.Oktober 2015 veröffentlicht wurde.