Nach einer Ausbildung zur Gestaltungstechnischen Assistentin im Bereich Graphik in Dresden studierte Johanna Heyne von 2010 bis 2014 im Bachelor Kunstgeschichte und Theaterwissenschaft an der Freien Universität in Berlin und der Università degli Studie di Firenze. Danach absolvierte sie ihr Masterstudium der Kunst- und Bildgeschichte an der Humboldt-Universität zu Berlin. Von Oktober 2015 bis März 2019 war sie als Forschungsstudentin am Graduiertenkolleg „Das Wissen der Künste" tätig.